La AE-IC se organiza en las siguientes secciones
- Teorías y métodos de investigación en comunicación
- Estudios de audiencia y recepción
- Estructura y políticas de la comunicación
- Estudios sobre el discurso
- Comunicación y cultura digital
- Producción y circulación de contenidos
- Comunicación estratégica y organizacional
Desde 2014 AE-IC dispone de los siguientes grupos de trabajo
- Comunicación y ciudadanía (adscrito a la sección de estructura y políticas de la comunicación)
- Estudios de género y comunicación (adscrito a la sección de estudios sobre el discurso).
- Historia de la investigación en comunicación (adscrito a la sección teorías y métodos de investigación en comunicación)
- Periodismo e información de calidad (adscrito a la sección de producción y circulación de contenidos).